醒酒器较长时间的存酒，瓶壁上总是会有单宁和色素的沉淀，形状上又很难清洗。侍酒师最传统的清洗方法是倒入粗盐，然后用力持久的摇晃，直到粗盐把沉淀磨去，颇讲摇晃技术，是经验丰富侍酒师的后厨招牌动作，而且粗盐的不规则很有划伤娇贵醒酒器的危险，那么如今大的酒具牌子有推出专门的代替品—盒亮晶晶的小金属球，摩擦力显然少了很多，更省力安全。另一种比较简单的方法是用稀释过的消毒水泡上一晚上，消毒水易蒸发，不会留下痕迹，再用热水冲洗便可，这一点比用醋泡好，用醋泡过之后往往会留下味道痕迹，这让再放进来的酒变得难以忍受。